医院先后获得“全国卫生系统先进集体”“全国卫生系统行风建设先进单位”“中医药科技管理工作先进集体”“全国中医护理先进集体”“全国医院(卫生)文化建设先进单位”(4次)“全国卫生系统思想政治工作先进单位”、“全国百家改革创新医院”、“全国人文爱心医院”、“中国抗疫医疗专家组组派工作表现突出单位”等称号，连续六届荣获“全国文明单位”称号。

　　2003年，医院在全疆三级甲等医院中率先通过了ISO9001：2000质量管理体系认证。2013年，医院伦理委员会被世界中医药学会联合会伦理审查委员会确定为“中医药临床研究伦理审查平台”单位。

　　医院现有4个“国家临床重点专科(中医专业)”(心血管病科、骨伤科、皮肤病科、肺病科)，10个国家中医药管理局“十二五”重点专科[心血管科、骨伤科、内分泌科、急诊科、皮肤科、肺病科、针灸科，重症医学科(培育项目)、临床药学(培育项目)、护理学(培育项目)]，8个国家中医药管理局重点学科[中医骨伤科学、中医皮肤病学、中医老年病学、临床中药学、中医肺病学、中医心病学、中医络病学(培育项目)、中医文化学(培育项目)]，4个国家中医药管理局区域中医(专科)诊疗中心项目[肺病专科、皮肤病专科、心血管专科、急诊(重症医学科)专科(培育项目)]，10个自治区级重点学科(中医肛肠病学、中医肺病学、中医内分泌病学、中医皮肤病学、中医脑病学、中医肾病学、推拿学、中医脾胃病学、中医心病学、针灸学);3个自治区临床重点专科(脑病科、检验科、医学影像科)。